Trò chơi có cốt truyện dựa trên bộ phim Starship Troopers nổi tiếng. Bộ phim là sản phẩm điện ảnh chuyển thể từ tác phẩm cùng tên Starship Troopers của nhà văn Mỹ Robert A. Heinlein, kể về một cuộc chiến diễn ra vào thế kỷ 23, khi Trái Đất dang rất thanh bình và mọi người đều sống dưới sự cai trị của một chính quyền Liên Bang duy nhất do chính họ bầu ra.[2]

Mong muốn trở thành một công dân tốt và do bị lôi kéo bởi tình yêu với cô bạn gái Ibanez từ thời trung học. Johnny Rico, nhân vật chính của câu chuyện, rời ghế nhà trường và gia nhập quân đội. Thời gian đó, mối đe dọa từ một loài sinh vật bí ẩn trên hành tinh Klendathu ngày một trở nên trầm trọng, nhất là sau khi quê hương BueKs Aires của Rico bị hủy diệt hoàn toàn trong một cuộc đột kích bất ngờ từ phía hành tinh nọ khiến gia đình và thậm chí là mái nhà của Rico đã không còn nữa. Hành động khiêu khích đó mở đầu cho một cuộc chiến đấu gian khổ của loài người. Nhằm mục đích tự bảo vệ, Liên Bang đã quyết định tấn công Klendathu để tiêu diệt tận gốc loài bọ khổng lồ, loại bỏ hoàn toàn mối đe dọa đối với Trái Đất.[2]

Quyết định đấu tranh chống lại quái vật không gian. Rico tham gia quân đội và được điều vào đội bộ binh cơ động thuộc quân đoàn Rough Neck rồi bay vào hành tinh Klendathu và tham gia một cuộc chiến nguy hiểm nhất để cứu sống nhân loại. Không ít bạn bè của anh đã hy sinh. Dưới sự dẫn dắt của Đại úy Razack, vốn là thây giáo cũ của anh khi còn đi học cùng với sự giúp đỡ của bạn bè trong quân ngũ, Rico đã trưởng thành nhanh chóng và lập nhiều chiến công để rồi thay đổi được cục diện của trận chiến này.[2]

Game được chia làm ba chương theo chân trung đội bộ binh cơ động của người chơi từ đầu cho đến khi cuộc chiến kết thúc.

Chương 1

Ngày 18 tháng 10 năm 2369, trung đội của người chơi lần đầu tiên đổ bộ xuống hành tinh Klendathu lúc cuộc chiến vừa mới bắt đầu chỉ với nhiệm vụ duy nhất là tấn công trực diện lũ bọ cho đến khi kết thúc bằng một cuộc rút quân toàn bộ. Tuy nhiên, trung đội của người chơi bị mắc kẹt trong quá trình di tản và buộc phải đối phó với loài bọ Plasma để đến nơi sơ tán một cách dễ dàng, trong khi giải cứu bất kỳ đội MI thuộc phe đồng minh trong khu vực. Không lâu sau nhiệm vụ tại Klendathu, ngày 23 tháng 11 năm 2369, trung đội của người chơi được gửi đến bãi biển Zegema để sơ tán đoàn hộ tống tiếp tế trong khu vực. Ngay sau nhiệm vụ màn bãi biển Zegema, trung đội của người chơi lại được triển khai đến Khu Kiểm dịch Arachnid (Arachnid Quarantine Zone) ở Dentana để giải cứu những cư dân địa phương trong khu vực, đồng thời ra tay bắt sống trực tiếp một mẫu vật Arachnid vào ngày 20 tháng 1 năm 2370. Hai nhiệm vụ cuối cùng của chương này diễn ra ở hành tinh P vào ngày 28 tháng 2 và 1 tháng 3 năm 2370, nơi người chơi được điều động tới bảo vệ tiền đồn Whiskey trong khi cố gắng bắt thêm nhiều mẫu vật hơn nữa. Chương đầu kết thúc với trung đội của người chơi trong một hang động gọi là "thành phố bọ" (Bug City), nơi trung đội của người chơi có điều kiện thuận lợi cho việc bắt giữ bọ não (Brain Bug).

Chương 2

Năm tháng đã trôi qua kể từ khi bắt được bọ não và bầy trứng rơi Arachnid (Arachnid Egg Fall Clusters) đã tấn công các hành tinh khác nhau trong vùng không gian do Liên Bang kiểm soát. Trung đội của người chơi được giao nhiệm vụ với mục tiêu hộ tống cho viên sĩ quan bộ nội vụ là Thiếu tá Alexander Bishop, trong khi đẩy lùi một cuộc xâm lược Sao Hỏa của Arachnid, cố gắng tái chiếm một thuộc địa được gọi là New Wellington khỏi Arachnid vì mục đích tinh thần quân đội, cũng như việc khám phá tính cách tự nhiên về cách thức mà Arachnid có thể tấn công có hiệu quả phe Liên Bang đặc biệt là với một cơ sở chế biến thực phẩm quan trọng và để mất hai cơ sở nghiên cứu quân sự quan trọng. Bishop và trung đội của người chơi được điều đến Axel 6, một tiền đồn khai thác nhỏ với giá trị chiến lược rất ít cùng một vài sĩ quan chỉ huy của các cơ sở như là một nhân chứng tiềm năng. Thiếu tá Bishop và người chơi phát hiện một viên sĩ quan cấp cao của Liên Bang là Đại tá Holland, đã để lộ thông tin tình báo trong những căn cứ Terran cho Arachnid thông qua con bọ não bị bắt, với hy vọng về sự đoàn kết nhân loại với các loài bọ. Bishop và trung đội của người chơi đã thành công trong việc tiêu diệt Holland và bắt sống bọ não trong khi đến giải cứu các nhà khoa học là chứng nhân cho sự phản bội của Holland. Mặc dù bản chất hành vi của Holland đã rõ rang thế nhưng Hội đồng Terran quyết định che đậy cái chết của Holland vì mục đích tinh thần và mong muốn nhanh chóng kết thúc cuộc chiến khốc liệt này.

Chương 3

Ngày 20 tháng 9 năm 2371, Liên Bang đã chế tạo ra loại vũ khí và công nghệ mới nhằm dùng để chống lại Arachnid và đã bắt đầu tiến hành phản công tiêu diệt Arachnid để đảm bảo kết thúc chiến tranh. Trung đội của người chơi được giao nhiệm vụ với mục tiêu giải cứu cho những người lính bộ binh cơ động bị mắc kẹt trên hành tinh P, cũng như sinh viên từ một học viện quân sự được sử dụng để huấn luyện phép tâm linh trên hành tinh Sirius 3 và phục hồi công nghệ dịch chuyển cổ xưa trên hành tinh G. Ngay sau khi nhiệm vụ thành công, người chơi được gửi đến Klendathu lần thứ hai và cuối cùng để tìm kiếm Nữ hoàng Arachnid. Bằng cách sử dụng chiến binh tâm linh để theo dấu nữ hoàng loài bọ cũng như tận dụng các thiết bị dịch chuyển ngược cho việc sơ tán khẩn cấp khi cần, cuối cùng trung đội của người chơi đã tìm thấy hang ổ của Nữ hoàng Arachnid và chiến đấu mở vòng vây giữa bầy đàn loài bọ hung dữ hiếu chiến đề rồi phải đặt quả bom Nova trong tổ và tìm cách thoát khỏi tổ trước khi nó phát nổ. Chiến tranh kết thúc vào ngày đầu năm mới 2372, với quân đội Terran ăn mừng chiến thắng của họ trước quân đoàn bọ Arachnid.